生技新藥從研發到臨床試驗，會面臨不同稅務議題。會計師提醒業者，以技術作價入股應事先評估稅負成本，慎選課稅時間點。根據國稅局解釋令，業者委託大陸研發測試新藥，其勞務報酬給付可回歸台灣來源所得認定，可以扣稅，可省下龐大稅賦成本。

       專精生技醫療產業的勤業眾信會計師虞成全表示，政府為鼓勵生技新藥開發，在「生技新藥產業發展條例」中，針對技術投資人員及高階專業人員的技術作價入股，訂定延緩課稅規定，也就是說，「技術作價」的課稅時點，可延緩到「股份轉讓」時。

       會計師陳惠明指出，緩課所得實現時，該技術股所得的計算方式，是按照該股票當時的轉讓價格，而不是技術股東出資時所抵繳的股款，換句話說，若股價漲得愈高，未來股票轉讓時所衍生的所得稅負也可能會愈高。他建議，生技新藥公司的技術股東於技術作價入股時，應先評估緩課後的稅負成本，再決定是否緩課。

       生技業者若委託外國公司研發或測試新藥，依照財政部96令釋規定，不對外國事業課徵我國所得稅，企業也不必辦理扣繳。但委託大陸業者進行醫藥研發，因我國稅局常有以「大陸事業非屬外國事業」，認為必須對大陸業者扣繳20％，造成生技業者稅賦負擔。

       虞成全說，後來勤業眾信會計師事務所向國稅局申請解釋，國稅局回應，應回歸台灣地區來源所得認定，不受限於財政部96令釋。他說，未來我國生技業者委託大陸業者研發測試，不需要負擔龐大的20％扣繳稅負。

       陳惠明進一步表示，國稅局上述回應有三個條件，受委託的大陸公司台在中華民國境內無固定營業場所及營業代理人；在我國內有營業代理人，但未代理該項業務；或在我國內有固定營業場所，但未參與及協助該項業務，則該技術報酬將不認列為台灣地區來源所得，而無須於給付時扣繳稅款。

(工商時報)2016年01月14日 04:10 記者劉峻谷／台北報導